食用菌屬且部分還是生長有點尷尬的環境，所以在進入我們口中之前殺菌少不了。 起初的食用菌殺菌設備可以通過壓力調整達到的，但是這樣的不僅無法保證培養料無菌，還會造成污染問題；而微波殺菌設備不會有污染，還能保證培養料的無菌，甚至是可以殺滅之前殺不了的病毒和細、。 所以目前微波殺菌設備正慢慢取代傳統食用菌殺菌設備。